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【佳學(xué)基因檢測】腫瘤臨床治療所需要的基因檢測

【佳學(xué)基因檢測】腫瘤臨床治療所需要的基因檢測 臨床中的生物標(biāo)志物檢測 靶向治療在特定患者亞組中顯示出良好的療效。確定這些亞組的過程隨著分子檢測方法的發(fā)展以及在研究和臨床實(shí)踐

佳學(xué)基因檢測】腫瘤臨床治療所需要的基因檢測


臨床中的生物標(biāo)志物檢測

靶向治療在特定患者亞組中顯示出良好的療效。確定這些亞組的過程隨著分子檢測方法的發(fā)展以及在研究和臨床實(shí)踐中的廣泛應(yīng)用,變得越來越準(zhǔn)確和高效。隨著這一過程的改進(jìn),越來越多的患者能夠獲得更合適的治療方案,從而使靶向治療成為一種比當(dāng)前常用的反復(fù)試驗(yàn)治療模式更具成本效益和普遍益處的選擇。

表格中的生物標(biāo)志物信息(表1)主要基于美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)發(fā)布的腫瘤臨床實(shí)踐指南(NCCN指南)、NCCN生物標(biāo)志物匯編,以及FDA的建議和批準(zhǔn))。雖然NCCN生物標(biāo)志物匯編詳細(xì)介紹了預(yù)測性標(biāo)志物,同時也涵蓋了預(yù)后、診斷、篩查、監(jiān)測等標(biāo)志物,但本綜述的重點(diǎn)是可用于指導(dǎo)治療決策的預(yù)測性生物標(biāo)志物。

在表1中,“證據(jù)”欄的分類基于可用的臨床證據(jù)水平,以及NCCN專家組和其他專家之間的共識程度。在某些情況下,臨床證據(jù)來自大型、精心設(shè)計的隨機(jī)對照試驗(yàn),而在許多情況下,證據(jù)主要依賴于隨機(jī)試驗(yàn)、第2階段或非隨機(jī)試驗(yàn)、多個小型試驗(yàn)、回顧性研究之間的間接比較數(shù)據(jù),或者僅僅是臨床觀察。在某些情況下,由于缺乏大量臨床數(shù)據(jù),證據(jù)僅來自于臨床經(jīng)驗(yàn)。根據(jù)這些因素以及數(shù)據(jù)的說服力,證據(jù)被評級為:

1.基于高水平證據(jù),NCCN和其他專家一致認(rèn)為干預(yù)措施是適當(dāng)?shù)模ǜ咚健V泛接受)。

2A. 根據(jù)較低級別的證據(jù),NCCN和其他專家一致認(rèn)為該干預(yù)措施是適當(dāng)?shù)模ㄝ^低級別,廣泛接受)。

2B. 根據(jù)較低級別的證據(jù),NCCN 和其他專家一致認(rèn)為干預(yù)措施是適當(dāng)?shù)模ㄝ^低級別,接受度有限)。

 

表 1:針對任何實(shí)體腫瘤的預(yù)測性微衛(wèi)星不穩(wěn)定性/錯配修復(fù)檢測

生物標(biāo)志物 測試檢測 什么時候 技術(shù) 建議 證據(jù) 癌癥類型
骨髓造血干細(xì)胞移植 表達(dá) 請參閱正文中的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高腫瘤和 DNA 錯配修復(fù) 免疫組織化學(xué) 建議對可用組織進(jìn)行 dMMR 和 MSI‐H 測試,以預(yù)測對 pembrolizumab 的反應(yīng) 水平較低;接受度廣 全部
MLH1、MSH2、MSH6或PMS2 突變(= dMMR 表達(dá))   新一代測序 在適用的情況下,dMMR 和 MSI‐H 檢測可結(jié)合使用,以確定患者是否應(yīng)接受林奇綜合征的進(jìn)一步突變檢測b    
微星 檢測(短重復(fù) DNA 序列的變化) 請參閱正文中的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高腫瘤和 DNA 錯配修復(fù) PCR、NGS 建議對可用組織進(jìn)行 dMMR 和 MSI‐H 測試,以預(yù)測對 pembrolizumab 的反應(yīng) 級別較低,接受度廣 全部
        在適用的情況下,dMMR 和 MSI‐H 檢測可結(jié)合使用,以確定患者是否應(yīng)接受林奇綜合征的進(jìn)一步突變檢測b    

縮寫:dMMR,錯配修復(fù)缺陷;IHC,免疫組織化學(xué);MMR,錯配修復(fù);MSI,微衛(wèi)星不穩(wěn)定性;MSI-H,微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高;NGS,下一代測序;PCR,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

a單獨(dú)使用 Nivolumab 或與 ipilimumab 聯(lián)合使用也可能是結(jié)直腸癌患者的一種選擇。

b dMMR 是林奇綜合征的一個特征,這種綜合征可能在胃腸道(尤其是結(jié)腸直腸癌)、子宮內(nèi)膜癌、卵巢癌、腦癌、乳腺癌和腎盂癌患者(尤其是年輕患者)中發(fā)揮作用。在林奇綜合征中,dMMR 導(dǎo)致重復(fù) DNA 序列修復(fù)不足,因此患多種惡性腫瘤的風(fēng)險更高。

 

表 2:目前推薦的 NSCLC 預(yù)測性分子檢測

生物標(biāo)志物 測試檢測 什么時候 技術(shù) 建議 證據(jù) 癌癥類型
堿性磷酸酶 基因融合 轉(zhuǎn)移性檢查 FISH、NGS、RT‐ PCR 口服 ALK TKI 有反應(yīng);阿來替尼作為一線治療的療效優(yōu)于克唑替尼 水平高、接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,NSCLC NOS
  融合蛋白表達(dá)   免疫組織化學(xué)      
    與“從不吸煙者”或小/混合組織學(xué)標(biāo)本中的EGFR檢測相結(jié)合   對口服 ALK TKI(例如克唑替尼)有反應(yīng) 級別較低,接受度廣 鱗狀細(xì)胞
表皮生長因子受體T790M 突變 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、多重突變檢測 對 EGFR TKI 有耐藥性 水平高、接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,NSCLC NOS
EGFR外顯子 21 (L858R, L861)、外顯子 20 (S768I)、外顯子 18 (G719X, G719) 突變 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、多重突變檢測 對 EGFR TKI 敏感 水平高、接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,NSCLC NOS
          級別較低,接受度廣 鱗狀細(xì)胞
EGFR外顯子19 刪除 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、多重突變檢測 對 EGFR TKI 敏感 水平高、接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,NSCLC NOS
          級別較低,接受度廣 鱗狀細(xì)胞
EGFR外顯子20 7p12 插入突變 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、多重突變檢測 可能對 EGFR TKI 有耐藥性 水平高、接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,NSCLC NOS
          級別較低,接受度廣 鱗狀細(xì)胞
ROS1 融合重排 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、FISH、RT-PCR 對 ROS1 TKI 有反應(yīng) 級別較低,接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,鱗狀細(xì)胞,NSCLC NOS
PD‐L1 蛋白表達(dá)≥50% 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、多重突變檢測 一線治療中對派姆單抗的反應(yīng);FDA 批準(zhǔn)的治療 級別較低,接受度廣 腺癌,大細(xì)胞,非小細(xì)胞肺癌,鱗狀細(xì)胞 NOS
克拉斯 突變 轉(zhuǎn)移性檢查 基因測序 對 EGFR TKI 有耐藥性。與KRAS野生型相比,預(yù)后較差 級別較低,接受度廣 所有 NSCLC
BRAF 突變,V600E 轉(zhuǎn)移性檢查 NGS、焦磷酸測序、AS-PCR 新興靶向藥物;對 BRAF 和 MEK 聯(lián)合抑制有反應(yīng) 級別較低,接受度廣 所有 NSCLC
HER2 突變 任何時間 NGS、多重突變檢測 新興靶向藥物 級別較低,接受度有限 所有 NSCLC
大都會 擴(kuò)增、突變 任何時間 新一代測序,熒光原位雜交 新興靶向藥物 級別較低,接受度廣 所有 NSCLC
回轉(zhuǎn)窯 融合、重排 任何時間 NGS、FISH、RT-PCR 新興靶向藥物 級別較低,接受度廣 所有 NSCLC

縮寫:AS-PCR,等位基因特異性聚合酶鏈反應(yīng);FDA,美國食品藥品監(jiān)督管理局;FISH,熒光原位雜交;IHC,免疫組織化學(xué);NGS,下一代測序;NOS,未另行指定;NSCLC,非小細(xì)胞肺癌;PD-L1,程序性死亡1配體;RT-PCR,逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng);TKIs,酪氨酸激酶抑制劑;wt,野生型。

a FISH 是美國食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的ALK基因重排檢測方法。NGS 和 RT-PCR 目前在臨床上尚未廣泛應(yīng)用。

b IHC 可以作為 FISH 的良好替代品。

不常見但重要的與部位無關(guān)的生物標(biāo)志物

微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高腫瘤和 DNA 錯配修復(fù) 

微衛(wèi)星不穩(wěn)定性 (MSI) 是 DNA 錯配修復(fù) (MMR) 系統(tǒng)失活的結(jié)果,其特征是微衛(wèi)星 DNA 中移碼突變的頻率很高。在部分腫瘤中,MSI 是由 MMR 基因之一(MLH1、MSH2、MSH6或PMS2 )的種系突變引起的,從而導(dǎo)致遺傳性林奇綜合征。然而,大多數(shù) (80%) MSI 病例是散發(fā)性的,通常是由于MLH1基因啟動子高甲基化所致。

MSI‐high (MSI‐H) 已在多達(dá) 24 種原發(fā)性癌癥類型中發(fā)現(xiàn),其中大部分顯示在表格中?表3,并且似乎是約 4% 所有成人癌癥的普遍癌癥表型。腫瘤 MSI-H 狀態(tài)具有預(yù)后意義(MSI-H 早期癌癥患者的預(yù)后優(yōu)于微衛(wèi)星穩(wěn)定腫瘤患者),也具有預(yù)測作用——許多 MSI-H 腫瘤對 PD-1/PD-L1 抑制劑極其敏感。

表 3:不同癌癥類型的 MSI‐H 狀態(tài)頻率

  % MSI‐H(數(shù)量/總數(shù))
癌癥類型 范德瓦爾德 2018 邦納維爾 2017 
所有癌癥類型 3.0(342 / 11,348) 3.8(425 / 11,139)
NSCLC(腺癌/鱗狀細(xì)胞癌b) 0.6(1868 年 12 月) 0.5‐0.6 (6/1065)
結(jié)直腸腺癌 5.7(80/1395)
結(jié)腸腺癌 19.7(85/431)
直腸腺癌 5.73(9/157)
胰腺腺癌 1.2(6/518) 0.0(0/183)
食管及食管胃連接處癌 0.0(0/189) 1.6(3/184)
胃腺癌 8.7(16/184) 19.1(84/440)
肝細(xì)胞癌 2.7(2/73) 0.8(3/375)
胃腸道間質(zhì)瘤 (GIST) 0.0(0/52)
卵巢表面上皮癌(漿液性囊腺癌c) 1.1(17/1517) 1.37(6/437)
非上皮性卵巢癌 1.8(1/56)
子宮內(nèi)膜癌 17.6(155/879) 31.4(170/542)
宮頸癌(鱗狀細(xì)胞癌/宮頸管腺癌d) 3.6(6/168) 2.6(8/305)
乳腺癌 0.6(6/1024) 1.5(16/1044)
前列腺腺癌 2.1(4/191) 0.6(3/498)
膀胱癌 0.0(0/143) 0.5(2/412)
膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(多形性) 0.7(3/427) 0.3(1/396)
(皮膚)黑色素瘤 0.0(0/345) 0.6(3/470)
頭頸部鱗狀細(xì)胞癌 0.0(0/111) 0.8(4/510)
肉瘤 0.78(2/255)
 

縮寫:MSI-H,微衛(wèi)星不穩(wěn)定性高;NO./TOTAL NO.,MSI-H 腫瘤數(shù)/檢測的腫瘤樣本總數(shù);NSCLC,非小細(xì)胞肺癌。

 

a數(shù)據(jù)來源:Vanderwalde A、Spetzler D、Xiao N、Gatalica Z、Marshall J。通過新一代測序確定 11,348 名患者的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性狀態(tài)并與 PD-L1 和腫瘤突變負(fù)擔(dān)進(jìn)行比較。Cancer Med。2018;7:746-756;以及 Bonneville R、Krook MA、Kautto EA 等人。39 種癌癥類型的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性概況。JCO Precis Oncol。2017;1:1-15。doi:10.1200/ PO.17.00073。

b Bonneville 2017 引用了檢測肺腺癌和鱗狀細(xì)胞癌,它們是 NSCLC 的亞型。Vanderwalde 2018 引用了一般 NSCLC。

c Bonneville 2017 引用了檢測性漿液性囊腺癌,這是卵巢表面上皮癌的一個亞型。Vanderwalde 2018 引用了一般卵巢表面上皮癌。

d Bonneville 2017 引用了檢測鱗狀細(xì)胞癌和宮頸管腺癌,它們是宮頸癌的亞型。Vanderwalde 2018 引用了一般宮頸癌。

 

目前,F(xiàn)DA 已批準(zhǔn)醫(yī)生使用 PD-1 抑制劑 pembrolizumab 治療不可切除或轉(zhuǎn)移性 MSI-H 或 MMR 缺陷 (dMMR) 實(shí)體瘤患者(部位不明)。目前,該批準(zhǔn)適用于既往治療后出現(xiàn)腫瘤進(jìn)展且沒有滿意替代治療方案的患者,以及在接受氟嘧啶、奧沙利鉑和伊立替康治療后出現(xiàn)進(jìn)展的 MSI-H 或 dMMR 結(jié)直腸癌 (CRC) 患者,以及非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC) 的一線治療患者。2017年,F(xiàn)DA 加速批準(zhǔn)了另一種 PD-1 抑制劑單藥 nivolumab,用于治療 12 歲以上的成人和兒童 MSI-H 或 dMMR CRC 患者。隨后,2018 年,F(xiàn)DA 加速批準(zhǔn)了nivolumab和 ipilimumab (一種 CTLA-4 抑制劑)的組合療法,用于治療同一組患者。見表格?表1有關(guān) MSI/MMR 生物標(biāo)志物檢測的建議。

神經(jīng)營養(yǎng)受體酪氨酸激酶 

神經(jīng)營養(yǎng)受體酪氨酸激酶 (NTRK) 融合致癌基因家族的成員NTRK1/NTRK2/NTRK3在罕見的成人癌癥類型和幾種兒童癌癥中最為常見,盡管它們只出現(xiàn)在極小比例(約 1%)的成人常見癌癥類型中,包括非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌、頭頸癌、甲狀腺癌、膀胱癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤和惡性黑色素瘤(表4 )。NTRK1 、NTRK2和NTRK3融合以及它們編碼的蛋白質(zhì)(分別為神經(jīng)營養(yǎng)因子受體激酶 A [TRKA]、TRKB 和 TRKC)在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤等高度侵襲性癌癥中出現(xiàn)的頻率增加,并且認(rèn)識到它們的潛在致癌活性導(dǎo)致將此融合家族用作預(yù)測生物標(biāo)志物以及藥物靶點(diǎn)。

 

表4:特定癌癥中的 NTRK 頻率

NTRK基因 腫瘤類型 FUSION PARTNERS 頻率(次數(shù)/總數(shù))
NTRK1 , n = 7 膠質(zhì)瘤 TPM3 , BCAN , MEF2D 0.3%(3/982)
結(jié)直腸癌 TPM3 0.2%(2/1272)
宮頸癌 TPM3 1.5%(1/68)
肺腺癌 TPM3 0.0%(1/4073)
NTRK2 , n = 10 膠質(zhì)瘤 VCAN、GKAP1、KCTD8、NOS1AP、TBC1D2、SQSTM1(n = 2)、BCR(n = 2)、PRKAR2A 0.9%(9/982)
肺腺癌 量子STM1 0.0%(1/4073)
NTRK3 , 例數(shù)為 8 膠質(zhì)瘤 免疫球蛋白? 0.2%(2/982)
肺腺癌 ETV6 0.0%(2/4073)
分泌性癌(乳腺) ETV6 0.1%(1/769)
子宮肉瘤 SPECC1L 0.2%(1/478)
原發(fā)灶不明的癌癥 ETV6 0.4%(2/227)

縮寫:NO./TOTAL NO.,融合腫瘤數(shù)/檢測的腫瘤樣本總數(shù)。

a這些是 Gatalica 等人確定的融合伴侶,這并不是所有當(dāng)前已知的NTRK融合伴侶的完整列表。

b這里提供的頻率數(shù)據(jù)與之前的研究基本一致,但由于研究的腫瘤數(shù)量巨大(篩查了超過 11,000 名患者),它們比其他研究更廣泛地概述了NTRK融合的頻率和類型。數(shù)據(jù)來自:Gatalica Z、Xiu J、Swensen J、 Vranic S。具有 NTRK 基因融合的癌癥的分子表征。Mod Pathol。2019;32:147-153.2018。

拉羅替尼是一種口服高選擇性 TRK 抑制劑,于 2018 年 11 月 26 日獲得 FDA 加速批準(zhǔn),用于治療具有NTRK融合且無已知獲得性耐藥突變(NTRK激酶結(jié)構(gòu)域突變,包括溶劑前沿突變)的轉(zhuǎn)移性或不可切除實(shí)體瘤的成人和兒童患者?;颊弑仨毣加性谥委熀蟛∏檫M(jìn)展的癌癥和/或沒有令人滿意的替代治療方法。拉羅替尼的獲批是繼派姆單抗之后,F(xiàn)DA 批準(zhǔn)的第二款用于治療癌癥的組織不可知藥物。

另一種 TRK 抑制劑恩曲替尼 (RXDX‐101) 于 2017 年被 FDA 授予突破性療法認(rèn)定,但尚未獲準(zhǔn)用于治療NTRK陽性、局部晚期或轉(zhuǎn)移性實(shí)體瘤的成人和兒童患者,這些患者要么在之前的治療后病情出現(xiàn)進(jìn)展,要么沒有可接受的標(biāo)準(zhǔn)治療方案。

NTRK融合檢測在過去一兩年內(nèi)發(fā)生了巨大變化,人們不斷通過各種不同的檢測方法發(fā)現(xiàn)新情況。下表中顯示的NTRK融合?(表4)取自 2018 年最初發(fā)表的一項(xiàng)研究。盡管當(dāng)時很全面,但該表并不包含 2019 年如今已知的融合完整列表。IHC 已被用作初步篩查工具,為高度敏感但可用性較低且價格昂貴的分子檢測方法提供信息。然而,現(xiàn)在很明顯,IHC 沒有足夠的靈敏度來檢測所有現(xiàn)有的NTRK融合編碼蛋白,這意味著腫瘤樣本從一開始就應(yīng)該使用 FISH 或 NGS 進(jìn)行檢測。總之,臨床醫(yī)生需要了解所有 3 個 TRK 靶點(diǎn),并為所有靶點(diǎn)安排充分的測試。

種系改變及其檢測 

基因突變可以是體細(xì)胞突變或生殖細(xì)胞突變;前者在出生后自發(fā)發(fā)生,而后者是遺傳的(即出生時存在)。腫瘤基因(體細(xì)胞)檢測可檢測出實(shí)際上可能是生殖細(xì)胞變異的突變,但生殖細(xì)胞變異需要在來自腫瘤宿主的匹配正常樣本(例如從白細(xì)胞、口腔拭子或培養(yǎng)的皮膚成纖維細(xì)胞中提取的 DNA)中確認(rèn)。疑似生殖細(xì)胞突變和基因檢測與癌癥治療和預(yù)防相關(guān)?;颊哂锌赡茉谄渌课换忌夏[瘤,或家庭成員有可能患上癌癥,尤其是早發(fā)性惡性腫瘤。

桌子?表5列出了可能為種系的體細(xì)胞突變。此表指示了如果在患者的腫瘤概況中發(fā)現(xiàn)指定的體細(xì)胞突變,則應(yīng)進(jìn)行種系檢測的癌癥類型。

表 5:廣為人知的體細(xì)胞突變也可能是種系突變


種系或體細(xì)胞突變 罕見的生殖細(xì)胞相關(guān)綜合征 主要癌癥適用性
TP53 李-法美尼 肉瘤、乳腺癌和腦癌
MSH2, MLH1, MSH6, PMS2, EPCAM 林奇 胃腸道癌癥(尤其是結(jié)直腸癌)、子宮內(nèi)膜癌、卵巢癌、腦癌、乳腺癌和腎盂癌
BRCA1, BRCA2 遺傳性乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌胰腺癌 乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和胰腺癌
PTEN 考登 乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌和甲狀腺癌
APC, MUTYH 家族性腺瘤性息肉病 結(jié)腸和直腸癌、小腸癌、胃癌、腦癌、骨癌和皮膚癌
CDH1 遺傳性彌漫性胃癌 胃癌和乳腺癌
CDK4, CDKN2A 家族性非典型多發(fā)性痣黑色素瘤 黑色素瘤、胰腺腺癌和腦星形細(xì)胞瘤
MEN1 沃納 胰腺內(nèi)分泌癌和垂體腫瘤
RB1 視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤 眼癌、松果體瘤、骨肉瘤、黑色素瘤和軟組織肉瘤
RET 多發(fā)性內(nèi)分泌腫瘤 2 型 髓樣甲狀腺癌和嗜鉻細(xì)胞瘤
VHL 馮·希佩爾-林道 腎癌和多種非癌性腫瘤
STK11 派茨-杰格斯 乳腺癌、結(jié)腸癌、直腸癌、胰腺癌、胃癌和錯構(gòu)瘤
SDHD, SDHB, SDHC 家族性副神經(jīng)節(jié)瘤 副神經(jīng)節(jié)瘤和嗜鉻細(xì)胞瘤
FLCN 伯特-霍格-杜貝 嫌色性腎細(xì)胞癌
TSC1, TSC2 結(jié)節(jié)性硬化癥 血管纖維瘤、血管平滑肌脂肪瘤、巨細(xì)胞星形細(xì)胞瘤
NF1 1 型神經(jīng)纖維瘤病 視神經(jīng)膠質(zhì)瘤和神經(jīng)纖維瘤
NF2 2 型神經(jīng)纖維瘤病 神經(jīng)鞘瘤、腦膜瘤、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、神經(jīng)纖維瘤
PTCH1 戈林 兒童原始神經(jīng)外胚層腫瘤、皮膚基底細(xì)胞癌
BMPR1A, SMAD4 幼年性息肉病 結(jié)腸內(nèi)有多處非癌性生長

縮寫:GI,胃腸道。

表格改編自:Lartigue J. 癌癥中種系突變和體細(xì)胞突變之間的界限模糊。Oncol Live。2017;18。onclive.com/publications/oncology-live/2017/vol-18-no-13/blurring-the-lines-between-germline-and-somatic-mutations-in-cancer。2019年 2 月 6 日訪問

 

腫瘤基因修飾主要有 3 類,它們之間的差異很大,但預(yù)期這些基因修飾反映了種系變化。第一類包括與罕見種系改變相關(guān)的常見腫瘤突變。例如,超過 60% 的肺癌患者存在TP53突變。盡管TP53突變可以在 Li‐Fraumeni 綜合征中遺傳,但這種家族性綜合征很少見。大多數(shù)人認(rèn)為,除非個人或家族病史提示有這種綜合征,否則幾乎不需要進(jìn)行種系檢測。第二類包括可能與家族性綜合征相關(guān)的中等常見體細(xì)胞突變。例如,在結(jié)腸癌中,常規(guī) MSI 或 IHC 檢測在約 12% 的腫瘤中發(fā)現(xiàn) dMMR。分子種系檢測表明,這些 dMMR 改變中約有四分之一是遺傳的。因此,腫瘤檢測應(yīng)能確認(rèn)患者的種系,并可能對家庭成員進(jìn)行進(jìn)一步評估。最后一類包括不常見的腫瘤突變,這些突變通常反映的是種系突變。例如,乳腺癌和卵巢癌患者定期進(jìn)行BRCA1和BRCA2種系檢測,特別是當(dāng)個人病史或家族病史具有提示性時。通過常規(guī)分子遺傳學(xué)腫瘤檢測,可以在其他不太可能出現(xiàn)這種突變的腫瘤患者中發(fā)現(xiàn)BRCA1 / BRCA2突變。對 100 名胰腺癌患者的分析發(fā)現(xiàn),7 名患者有BRCA2突變,其中 4 名是種系突變。發(fā)現(xiàn)腫瘤中的BRCA1/BRCA2突變可能有助于選擇治療方法,但需要進(jìn)行種系檢測以確認(rèn),并考慮為家人提供遺傳咨詢。

人們通常認(rèn)為,如果已經(jīng)進(jìn)行了體細(xì)胞腫瘤檢測,就不一定需要進(jìn)行種系檢測。然而,必須記住,分子遺傳腫瘤檢測可能會漏掉一小部分遺傳病例,這些病例的突變不在體細(xì)胞面板所涵蓋的熱點(diǎn)范圍內(nèi),或者發(fā)生了大規(guī)模的缺失和重復(fù)。相反,盡管缺乏相關(guān)的臨床病史,但更大的基因組分析實(shí)際上可能會識別出以前未知的、臨床相關(guān)的種系改變,無論是新生的還是從父母那里遺傳的。

總之,考慮到種系檢測和全外顯子組測序在識別可遺傳突變方面的應(yīng)用越來越廣泛,以及個人和家族癌癥病史以及潛在的遺傳咨詢需求,醫(yī)療團(tuán)隊可以幫助為某些類型癌癥患者提供更好的治療選擇,并有助于創(chuàng)建系統(tǒng)的遺傳風(fēng)險方法。


(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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