【佳學(xué)基因檢測(cè)】先天性心臟病分子診斷怎么做?
分子診斷導(dǎo)讀:
先天性心臟病是一種由基因序列異常引起的疾病。診斷和治療需要采用分子診斷技術(shù)。佳學(xué)基因通過基因解碼建立這一疾病的臨床表征與基因序列變化的關(guān)系,可以提供致力找到病因、阻斷遺傳的基因解碼和出于風(fēng)險(xiǎn)考慮的基因檢測(cè)。先天性心臟?。–HD)是最常見的先天性畸形,也是導(dǎo)致死亡的主要原因。 根據(jù)《心臟病的基因序列及其基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)》,90% 的先天性心臟?。–HD) 病例由遺傳病因引起,但是如果采用數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)技術(shù),高達(dá) 55% 的患者通過數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)采用的分子診斷無(wú)法得到。 致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn)拷貝數(shù)變異和非整倍性約占總病例的 23%,基因解碼采用高通量基因組技術(shù)揭示了先天性心臟病(CHD)多種不同類型的遺傳變異。 通過高通量測(cè)序鑒定出的第一個(gè)冠心病風(fēng)險(xiǎn)基因型是從頭突變,其中許多發(fā)生在染色質(zhì)修飾基因中。 小鼠心臟發(fā)生模型進(jìn)一步支持了染色質(zhì)修飾先天性心臟病(CHD)突變的破壞性。 通過對(duì)人群規(guī)模的先天性心臟病(CHD) 隊(duì)列進(jìn)行測(cè)序也鑒定出了傳遞性突變,許多傳遞性突變富含纖毛基因和 Notch 或 VEGF 途徑基因。 雖然基因解碼在確定先心病的病因方面已經(jīng)取得了很大的進(jìn)展,但還需要做更多的工作來(lái)優(yōu)化所有先心病家族的診斷過程。 對(duì)冠心病的復(fù)雜遺傳解釋開始在醫(yī)生之間推廣,也需要對(duì)非常大的冠心病隊(duì)列應(yīng)用越來(lái)越復(fù)雜的分析策略,為遺傳上無(wú)法解決的患者提供分子診斷。 佳學(xué)基因從先心病的遺傳結(jié)構(gòu)和參與其發(fā)病機(jī)制的生物學(xué)途徑更為清晰和正確的為先心病患者提供分子診斷。
先天性心臟病疾病介紹:
先天性心臟病是先天性畸形中最常見的一類,約占各種先天畸形的28%,指在胚胎發(fā)育時(shí)期由于心臟及大血管的形成障礙或發(fā)育異常而引起的解剖結(jié)構(gòu)異常,或出生后應(yīng)自動(dòng)關(guān)閉的通道未能閉合(在胎兒屬正常)的情形。先天性心臟病發(fā)病率不容小視,占出生活嬰的0.4%~1%,這意味著我國(guó)每年新增先天性心臟病患者15~20萬(wàn)。先天性心臟病譜系特別廣,包括上百種具體分型,有些患者可以同時(shí)合并多種畸形,癥狀千差萬(wàn)別,最輕者可以終身無(wú)癥狀,重者出生即出現(xiàn)嚴(yán)重癥狀如缺氧、休克甚至夭折。根據(jù)血液動(dòng)力學(xué)結(jié)合病理生理變化,先天性心臟病可分為發(fā)紺型或者非發(fā)紺型,也可根據(jù)有無(wú)分流分為三類:無(wú)分流類(如肺動(dòng)脈狹窄、主動(dòng)脈縮窄)、左至右分流類(如房間隔缺損、室間隔缺損、動(dòng)脈導(dǎo)管未閉)和右至左分流(如法洛氏四聯(lián)癥、大血管錯(cuò)位)類。
先天性心臟病基因解碼
根據(jù)《人的基因序列變化與人體疾病表征》,過去有部分機(jī)構(gòu)和醫(yī)務(wù)人員認(rèn)為先天性心臟病不是遺傳性疾病,甚至有人認(rèn)為該病不是由基因引起的,先天性心臟病發(fā)生的內(nèi)在基因原因被忽視。佳學(xué)基因通過基因解碼找到并定位了導(dǎo)致這一疾病發(fā)生的原因,提出了先天性心臟病的遺傳風(fēng)險(xiǎn),并建議通過基因檢測(cè)明確和排除風(fēng)險(xiǎn),讓后代、二胎不再患有先天性心臟病,實(shí)現(xiàn)先天性心臟病遺傳阻斷的目的。
非整倍體和拷貝數(shù)變異
核型分析基因檢測(cè)可以檢測(cè)大于 5-10 Mb 的染色體改變,并發(fā)現(xiàn)與先天性心臟?。–HD)相關(guān)的非整倍體,包括 21 三體(房室管缺陷)、18 三體(VSD 和肺動(dòng)脈狹窄)、13 三體(ASD、VSD 和 TGA)、Turner 綜合征(室間隔缺損、主動(dòng)脈縮窄和主動(dòng)脈瓣狹窄)和克蘭費(fèi)爾特綜合征(埃布斯坦異常和法洛四聯(lián)癥 [TOF])。 佳學(xué)基因綜述了非整倍體及其與先天性心臟?。–HD)的關(guān)系。
拷貝數(shù)的增加和減少對(duì)綜合征性和非綜合征性先天性心臟?。–HD)都有很大影響。 經(jīng)常由拷貝數(shù)變異 (CNV) 引起的先心病包括 22q11.2 缺失綜合征、Williams-Beuren 綜合征(7q11.23 缺失)、Cri-Du-Chat 綜合征(5p15.2 缺失)、貓眼綜合征(22q11 倒位或重復(fù)) 、雅各布森綜合征(11q缺失)、1p36缺失綜合征、1q21.1缺失/重復(fù)綜合征、8p23.1缺失綜合征等。 通過全外顯子組測(cè)序 (WES) 和基因型陣列對(duì) 538 名先心病三人組進(jìn)行大型隊(duì)列分析,結(jié)果顯示 9.8% 的患者存在新發(fā) CNV,而之前沒有發(fā)現(xiàn)遺傳發(fā)病機(jī)制。 先心病致病基因鑒定基因解碼開展的一項(xiàng)針對(duì) 2517 名 WES 冠心病患者的擴(kuò)大隊(duì)列研究發(fā)現(xiàn),5.22% 的病例中存在新生 CNV,而且新生 CNV 的存在也與心外異常和臨床結(jié)果(例如無(wú)移植生存期和最終時(shí)間)顯著相關(guān)。
新發(fā)突變
致病基因鑒定基因解碼應(yīng)用 WES 系統(tǒng)評(píng)估從頭單核苷酸變異和小插入/缺失對(duì)先天性心臟?。–HD)測(cè)序的 362 個(gè)三人組(CHD 患者及其父母)的影響,并使用病例對(duì)照設(shè)置來(lái)表明先天性心臟?。–HD)患者相對(duì)富集 de 發(fā)育中心臟(HHE 基因)中高度表達(dá)的基因的新生突變(DNM。 此外,心臟病基因解碼基因檢測(cè)的研究表明,先天性心臟病(CHD)患者的染色質(zhì)修飾基因中 DNM 富集; 如今,預(yù)計(jì)這些疾病將占所有先天性心臟病(CHD) 的 2.3%。 心臟病基因解碼基因的研究表明,染色質(zhì)修飾 DNM 占綜合征性 CHD(與 NDD 或 ECA 相關(guān))的 28%。
基因解碼研究表明,DNM 解釋了大約 10% 的先天性心臟?。–HD),佳學(xué)基因的模型分析表明,至少 400 個(gè)富含致病性 DNM 的基因?qū)е?CHD。 然而,富含 DNM 的 CHD 基因包還在不斷豐富。 發(fā)現(xiàn)的含有一種以上蛋白質(zhì)損傷性 DNM 的 CHD 基因數(shù)量已經(jīng)增加到 66 個(gè)( 2645 個(gè)病例三人組),這清楚地表明還有更多的 CHD 風(fēng)險(xiǎn)基因未被列入通用的基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)中。
這些研究結(jié)果表明,DNM 中與 CHD 相關(guān)的最重要的一類基因是染色質(zhì)修飾基因。 染色質(zhì)修飾劑通過控制 DNA 的進(jìn)入來(lái)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄。 染色質(zhì)修飾,例如乙?;⒓谆头核鼗?,發(fā)生在四個(gè)核心組蛋白(H2A、H2B、H3 和 H4)上。 由于染色質(zhì)修飾的添加和去除會(huì)改變 DNA 的緊密度,因此在發(fā)育過程中適當(dāng)?shù)目刂浦陵P(guān)重要。鑒于染色質(zhì)修飾劑在心臟發(fā)育中的主要作用,與對(duì)照組相比,CHD 患者的染色質(zhì)修飾劑變異顯著豐富也就不足為奇了。 表觀遺傳修飾劑的變異可以對(duì)患者產(chǎn)生多效性影響,因?yàn)樗鼈冇绊懺S多基因的表達(dá)。 值得注意的是,染色質(zhì)修飾劑中存在 DNM 的患者已被證明患 NDD 的風(fēng)險(xiǎn)增加。 因此,這些基因的突變有可能成為預(yù)測(cè)先心病臨床結(jié)果的推定生物標(biāo)志物。
Molecular Genetics and Complex Inheritance of Congenital Heart Disease - PMC (nih.gov)
如何做先天性心臟病基因檢測(cè)?
佳學(xué)基因組織了國(guó)際和國(guó)內(nèi)這一領(lǐng)域的病理學(xué)家、分子生物學(xué)家、基因信息專家,利用基因解碼技術(shù),明確并定位了導(dǎo)致先天性心臟病發(fā)生的基因原因、基因片段和基因位點(diǎn),通過基因檢測(cè)在婚前、孕前、發(fā)病前或者是發(fā)病后都能正確地知道體內(nèi)是否有導(dǎo)致先天性心臟病發(fā)生的基因序列。檢測(cè)非常簡(jiǎn)單。只需要在社區(qū)診所、當(dāng)?shù)蒯t(yī)院采集少量抗凝靜脈血,并將抗凝靜脈血快遞到佳學(xué)基因基因解碼實(shí)驗(yàn)室就可以了。致電4001601189,也可以得到佳學(xué)基因解碼師的幫助。
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