【佳學(xué)基因檢測】先天性糖基化障礙Iip型基因檢測:基因數(shù)量及基因位點的更新
先天性糖基化障礙Iip型基因檢測:基因數(shù)量及基因位點的更新
先天性糖基化障礙(Congenital Disorders of Glycosylation, CDG)是一類由糖基化過程異常引起的遺傳性疾病。這些疾病通常是由于特定基因突變導(dǎo)致糖基化酶或相關(guān)酶的功能缺陷,從而影響糖基化的正常過程。
對于I型(又稱CDG-I型)糖基化障礙的基因檢測,主要涉及以下幾類基因:
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PMM2基因:編碼磷酸甘露糖異構(gòu)酶2,這是最常見的CDG-I型的相關(guān)基因,突變會導(dǎo)致PMM2-CDG(也稱為CDG-Ia)。
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MPI基因:編碼麥芽糖異構(gòu)酶,這個基因突變會導(dǎo)致MPI-CDG(也稱為CDG-Ib)。
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ALG3基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ic的相關(guān)基因。
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ALG6基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Id的相關(guān)基因。
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ALG8基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ie的相關(guān)基因。
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ALG12基因:編碼糖基轉(zhuǎn)移酶,是CDG-Ig的相關(guān)基因。
隨著基因組學(xué)和臨床研究的不斷進(jìn)展,對這些基因的了解也在不斷更新。新的基因突變和基因變異可能會被發(fā)現(xiàn),并被納入到基因檢測的范圍中。此外,一些基因的突變可能會影響糖基化途徑的不同環(huán)節(jié),導(dǎo)致不同類型的CDG-I型疾病。
如果你需要最新的基因數(shù)量和基因位點的詳細(xì)信息,可以查閱《人體基因序列變化懷疾病表征數(shù)據(jù)庫》,也可以查閱如OMIM(在線孟德爾遺傳疾病數(shù)據(jù)庫)、ClinVar(臨床變異數(shù)據(jù)庫)等。這些資源會提供有關(guān)各個基因及其突變的最新信息,并反映基因檢測的最新進(jìn)展。
先天性糖基化障礙Iip型(Congenital Disorder of Glycosylation, Type Iip)的致病基因鑒定采用什么基因檢測方法?
先天性糖基化障礙Iip型的致病基因鑒定通常采用全外顯子測序(whole exome sequencing)或全基因組測序(whole genome sequencing)等高通量測序技術(shù)進(jìn)行基因檢測。這些技術(shù)可以幫助鑒定患者的基因突變或變異,從而確定疾病的致病基因。
先天性糖基化障礙Iip型(Congenital Disorder of Glycosylation, Type Iip)的致病基因鑒定采用全外顯子測序加上基因解碼的優(yōu)勢?
先天性糖基化障礙Iip型是一種罕見的遺傳性疾病,其致病基因可能存在于任何一個基因中。因此,全外顯子測序可以同時檢測所有基因的變異,有助于快速準(zhǔn)確地確定患者的致病基因。此外,基因解碼可以幫助研究人員理解這些基因的功能和與疾病發(fā)病機制之間的關(guān)系,為未來的治療和預(yù)防提供重要的參考。因此,全外顯子測序加上基因解碼的方法在先天性糖基化障礙Iip型的致病基因鑒定中具有重要的優(yōu)勢。
先天性糖基化障礙Iip型概述
先天性糖基化障礙IIp型(CDG2P)是一種常染色體隱性遺傳代謝疾病,主要表現(xiàn)為輕度的肝功能異常,通常在青春期通過常規(guī)檢查偶然發(fā)現(xiàn)。實驗室檢查常見異常包括肝酶和堿性磷酸酶水平升高、凝血因子缺乏、高膽固醇血癥以及低銅藍(lán)蛋白。血清等電聚焦分析顯示N-和O-糖基化同時存在缺陷,提示可能是高爾基體功能缺陷(Jansen等,2016年總結(jié))。
先天性糖基化障礙Iip型臨床特征
Jansen等(2016年)報告了來自3個無關(guān)家庭的4例患者,這些患者的主要特征是輕度代謝障礙,主要影響肝臟。其中三名患者(包括兩名出生于近親希臘家庭的兄弟姐妹)在青春期的常規(guī)血液檢查中發(fā)現(xiàn)肝酶升高。三名患者的精神運動發(fā)育正常。其他實驗室異常包括低銅藍(lán)蛋白、高膽固醇血癥、堿性磷酸酶升高和凝血因子減少。肝臟影像學(xué)檢查或活檢顯示脂肪變性。這些實驗室異常在某些患者中會波動或隨年齡改善。41歲時的一名患者肝臟活檢顯示輕度纖維化、肝細(xì)胞空泡變性、高爾基體和/或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)擴張及囊泡形成,以及線粒體異常,如線粒體脊柱斷裂和內(nèi)基質(zhì)改變(Calvo等,2008年)。第四名患者是一名23歲的希臘女性,早期兒童期被發(fā)現(xiàn)有肌張力低下和精神運動障礙,后來發(fā)現(xiàn)肝酶和堿性磷酸酶升高、高膽固醇血癥和低銅藍(lán)蛋白,但未能進(jìn)行后續(xù)跟蹤。這些患者的血清轉(zhuǎn)鐵蛋白等電聚焦(IEF)顯示2型模式,提示N-糖基化異常,同時ApoC-III的IEF異常提示O-糖基化異常。
先天性糖基化障礙Iip型遺傳方式
Jansen等(2016年)報告的CDG2P家系的遺傳模式與常染色體隱性遺傳一致。
先天性糖基化障礙Iip型分子遺傳學(xué)
Jansen等(2016年)在來自3個無關(guān)家庭的4例CDG2P患者中,發(fā)現(xiàn)了TMEM199基因(616815)中的純合突變或復(fù)合雜合突變。前兩個家系的突變通過全外顯子組測序發(fā)現(xiàn),所有突變都與該疾病在家系中的遺傳模式一致。通過質(zhì)譜分析檢測一名患者的轉(zhuǎn)鐵蛋白和總血漿N-糖基,發(fā)現(xiàn)與對照組相比,糖基合成不完全,缺乏半乳糖和唾液酸?;颊叩某衫w維細(xì)胞顯示與對照組相比,高爾基體蛋白糖基化處理的普遍缺陷,并且該缺陷在轉(zhuǎn)導(dǎo)了野生型TMEM199后得到恢復(fù)。兩家族患者細(xì)胞的Western blot分析顯示TMEM199蛋白水平降低,但未對變異體進(jìn)行直接功能研究。