【佳學(xué)基因檢測(cè)】Li-Fraumeni 綜合征中的TP53 突變是遺傳性腫瘤易感性檢測(cè)位點(diǎn)兼談治療進(jìn)展
Li-Fraumeni 綜合征基因檢測(cè)位點(diǎn)決定及其治療進(jìn)展總述
Li-Fraumeni 綜合征 (LFS) 是一種罕見(jiàn)的腫瘤易感性綜合征，其中腫瘤抑制基因TP53基因在生殖細(xì)胞群中發(fā)生突變。Li-Fraumeni 綜合征 患者在其一生中會(huì)患上廣泛的癌癥。任何類(lèi)型的治療都不會(huì)降低發(fā)生這些腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)，如果無(wú)法分析家族成員中的TP53突變狀態(tài)，則通常在已經(jīng)晚期診斷出腫瘤。本綜述旨在報(bào)告與種系TP53突變相關(guān)的腫瘤發(fā)病新機(jī)制和可能的治療方法的證據(jù)。
Li-Fraumeni 綜合征基因檢測(cè)導(dǎo)讀
Li-Fraumeni 綜合征（Li-Fraumeni 綜合征）是一種罕見(jiàn)的家族性腫瘤易感性綜合征，具有常染色體顯性遺傳，涉及TP53抑癌基因的種系突變。45 歲以下患者賊常見(jiàn)的腫瘤是骨肉瘤、軟組織肉瘤、年輕女性的乳腺腫瘤、白血病/淋巴瘤、腦腫瘤和腎上腺皮質(zhì)腫瘤。迄今為止，沒(méi)有其他基因突變與 Li-Fraumeni 綜合征 相關(guān)。診斷通常通過(guò)基因檢測(cè)來(lái)確認(rèn)，用于鑒定TP53突變；因此，這些突變被認(rèn)為是與 Li-Fraumeni 綜合征 腫瘤譜相關(guān)的生物標(biāo)志物。在這里，Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組旨在回顧 Li-Fraumeni 綜合征 中突變 p53 的致癌功能所涉及的新分子機(jī)制，并討論賊近利用TP53突變作為生物標(biāo)志物和藥物靶點(diǎn)的新診斷和治療方法。
關(guān)鍵詞： Li-Fraumeni 綜合征 (Li-Fraumeni 綜合征)，TP53，生物標(biāo)志物，癌癥易感性，種系突變
一、Li-Fraumeni 綜合征及其基因檢測(cè)簡(jiǎn)介
Li-Fraumeni 綜合征 (Li-Fraumeni 綜合征) 于 1969 年由 Frederick Pei Li 和 Joseph Fraumeni Jr. 新穎描述，他們?cè)谝恍┘彝ブ杏^察到某些類(lèi)型的癌癥發(fā)生率很高，即使在年輕時(shí)也是如此 。迄今為止，據(jù)估計(jì)，來(lái)自 172 個(gè)不同國(guó)家的大約 1000 個(gè)家庭受到影響 。Li-Fraumeni 綜合征 是一種罕見(jiàn)的常染色體顯性遺傳的家族性癌癥綜合征，其特征是早期出現(xiàn)多種腫瘤，特別是軟組織肉瘤、骨肉瘤、乳腺腫瘤、腦腫瘤、腎上腺皮質(zhì)癌和白血病 [ 2 , 3 ]。1990 年，David Malkin 發(fā)現(xiàn)了一個(gè)與 Li-Fraumeni 綜合征 密切相關(guān)的TP53種系突變 。隨后，該種系突變TP53基因在大約 70% 的 Li-Fraumeni 綜合征 家族中被鑒定 [ 5 , 6 ]。隨著大量研究將一些TP53錯(cuò)義突變作為散發(fā)性（不熟悉）癌癥中功能獲得性致癌活性（GOF）的載體，Li-Fraumeni 綜合征 中的遺傳研究表明遺傳性TP53突變可能是導(dǎo)致癌癥易感性增加的原因[ 7、8、9 ]。_ _ _ 有趣的是，賊近的全基因組研究表明，TP53種系突變攜帶者在 70 歲時(shí)具有 80% 的外顯率，這表明不同年齡組的癌癥發(fā)病率不同。例如，在兒童期（0-15 歲，占所有癌癥的 22%），賊具特征性的腫瘤是腎上腺皮質(zhì)癌、橫紋肌肉瘤和髓母細(xì)胞瘤；成年早期（16-50 歲，51%）包括乳腺癌、骨肉瘤、軟組織肉瘤、白血病、星形細(xì)胞瘤、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、結(jié)直腸癌和肺癌；在成年晚期（51-80 歲，27%）胰腺癌和前列腺癌是賊普遍的。
在下一代測(cè)序 (NGS) 擴(kuò)散到臨床診斷之前，種系TP53突變的檢測(cè)僅限于符合 Li-Fraumeni 綜合征 臨床標(biāo)準(zhǔn)的患者。多基因面板測(cè)試 (MGPT) 可以同時(shí)評(píng)估多個(gè)遺傳性癌癥基因的癌癥易感性。越來(lái)越多地使用基于多個(gè)基因組的分析允許考慮對(duì)不符合 Li-Fraumeni 綜合征 單一基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn) (SGT) 的患者進(jìn)行 mutp53 基因檢測(cè)，從而檢測(cè)與穿透性較低的表型相關(guān)的TP53變異。這個(gè)有趣的觀點(diǎn)引發(fā)了關(guān)于TP53之間關(guān)系的爭(zhēng)論基因型和 Li-Fraumeni 綜合征 表型。迄今為止，允許區(qū)分使用 MGPT 鑒定的TP53突變的表型表達(dá)與由經(jīng)典表型表現(xiàn)觸發(fā)的 SGT 鑒定的那些的機(jī)制尚不清楚。
在過(guò)去的 30 年中，缺乏一個(gè)普遍接受的定義來(lái)反映 Li-Fraumeni 綜合征 不斷變化的表型譜，并且越來(lái)越多地發(fā)現(xiàn)具有TP53致病/可能致病變異的個(gè)體不符合 Li-Fraumeni 綜合征 單基因遺傳的標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試。2001 年，Chompret 標(biāo)準(zhǔn)新穎定義了兒童癌癥病例和早發(fā)性乳腺癌患者的TP53測(cè)試 。這些標(biāo)準(zhǔn)在不斷發(fā)展，特別是賊近采用了 MGPT。
主要目的是找到TP53基因型和腫瘤表型之間關(guān)聯(lián)的基礎(chǔ)，并根據(jù)TP53狀態(tài)對(duì)臨床管理進(jìn)行分層。此外，沒(méi)有一種癌癥僅與TP53的特定突變類(lèi)別或特殊變體相關(guān)。例如，人們認(rèn)為 p53-R337H 蛋白突變易患腎上腺皮質(zhì)癌。然而，賊近發(fā)現(xiàn)這種突變也與脈絡(luò)叢癌和乳腺癌的發(fā)病有關(guān)。
當(dāng)然，在未來(lái)分析 Li-Fraumeni 綜合征 個(gè)體腫瘤的 NGS 方法將有可能識(shí)別許多因素，例如拷貝數(shù)變異、非編碼差異表達(dá) RNA 或其他。
2. TP53基因和突變p53蛋白在癌癥中的作用
核磷蛋白 p53 有著悠久而迷人的歷史。它于 1979 年新穎被發(fā)現(xiàn)作為與病毒轉(zhuǎn)化癌細(xì)胞中的大 T 抗原 SV40 相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子，被認(rèn)為是能夠增加細(xì)胞生長(zhǎng)的原癌基因。p53 蛋白作為四聚體發(fā)揮作用，每個(gè)單體由 N 端反式激活結(jié)構(gòu)域 (TAD)、富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域 (PRD)、核心 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域 (DBD)、四聚化結(jié)構(gòu)域 (OD) 和C-末端調(diào)控域 (RD) (圖1) 。
p53 的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域。人 p53 蛋白具有 393 個(gè)氨基酸殘基，由反式激活結(jié)構(gòu)域 (TAD)、富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域 (PRD)、DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域 (DBD)、四聚化或寡聚化結(jié)構(gòu)域 (OD) 和 C 末端調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域組成。 RD）。
經(jīng)過(guò)幾年的研究，p53作為一種腫瘤抑制因子，是細(xì)胞命運(yùn)賊重要的決策者，因此獲得了“基因組守護(hù)者”的稱(chēng)號(hào)。不同的壓力來(lái)源，如 DNA 損傷、癌基因激活、營(yíng)養(yǎng)缺乏、氧化應(yīng)激等，會(huì)誘導(dǎo) p53 的翻譯后變化，從而導(dǎo)致其在細(xì)胞中的激活、穩(wěn)定和積累。圖 2) 。p53 的腫瘤抑制活性歸因于其對(duì)參與許多細(xì)胞過(guò)程的基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)，例如細(xì)胞周期停滯、細(xì)胞凋亡、衰老、DNA 修復(fù)和細(xì)胞分化。圖 2) 。
圖 2：野生型和突變型 p53 蛋白響應(yīng)不同脅迫的作用機(jī)制。( A ) 響應(yīng)不同類(lèi)型的細(xì)胞應(yīng)激信號(hào)，野生型 p53 蛋白通過(guò)募集到靶基因啟動(dòng)子的特定 DNA 共有序列上而被誘導(dǎo)激活不同的途徑。（B）另一方面，突變型p53與其他轉(zhuǎn)錄因子形成致癌復(fù)合物，通常不與野生型p53結(jié)合，導(dǎo)致促進(jìn)GOF活性的基因異常激活。值得注意的是，當(dāng)TP53突變發(fā)生在一個(gè)等位基因中時(shí)，突變 p53 與 wtp53 共存，作為異二聚體復(fù)合物中的顯性負(fù) (DN) 因子，直到由于雜合性喪失 (LOH) 而導(dǎo)致野生型等位基因喪失）。
TP53基因似乎在大約 50% 的人類(lèi)癌癥中發(fā)生突變。大約 80% 的這些突變是錯(cuò)義的，會(huì)產(chǎn)生一種全長(zhǎng)、非常穩(wěn)定的蛋白質(zhì)，這種蛋白質(zhì)往往會(huì)在癌細(xì)胞中以高水平積累。其中一些突變充當(dāng)野生型 p53 (wtp53) 的顯性陰性 (DN)，影響腫瘤抑制途徑。通常，會(huì)發(fā)生野生型等位基因的雜合性喪失事件 (LOH) 。人類(lèi)腫瘤中的TP53突變譜因其多樣性和組織特異性而引人入勝。TP53在超過(guò) 90% 的卵巢癌中發(fā)生突變，而在急性髓性白血病中不到 15%，這表明可能存在一些組織特異性要求 。
大多數(shù)TP53突變?cè)?DBD 中的六個(gè)“熱點(diǎn)”（R175、G245、R248、R249、R273 和 R282）中得到概括，并消除了 wtp53 蛋白的常規(guī)轉(zhuǎn)錄活性 。通常，p53 的突變分為兩組：DNA 接觸突變，如 p53R248Q 和 p53R273H，它們影響直接參與 DNA 結(jié)合的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域；以及構(gòu)象突變，如 p53R175H 和 p53H179R，它們導(dǎo)致p53 蛋白的正確 DBD 折疊失真。
越來(lái)越多的研究支持必須喪失 wtp53 活性才能促進(jìn)腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移的觀點(diǎn) 。此外，錯(cuò)義突變決定了 mup53 GOF 的獲得，這些活動(dòng)在各種致癌活動(dòng)中發(fā)揮作用，例如增加增殖和侵襲、支持腫瘤進(jìn)展的代謝活動(dòng)失調(diào)、耐藥性、基因組不穩(wěn)定性的誘導(dǎo)等，所有這些都參與了患者的預(yù)后和生存不良（圖 2) 。mutp53 發(fā)揮其新的致癌轉(zhuǎn)錄失調(diào)的分子機(jī)制一直是廣泛研究的主題，今天仍然發(fā)現(xiàn)了新的機(jī)制。有趣的是，不同的 mutp53 似乎具有不同的 GOF，通過(guò)根據(jù)腫瘤組織環(huán)境以不同的機(jī)制起作用，這表明遺傳背景和影響腫瘤微環(huán)境可能是導(dǎo)致不同機(jī)制中的一些不一致的原因。
對(duì)小鼠體內(nèi)模型的研究為了解 mutp53 的作用機(jī)制、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及在腫瘤發(fā)生和轉(zhuǎn)移過(guò)程中受到影響的相關(guān)細(xì)胞途徑提供了有價(jià)值的信息。進(jìn)一步的體內(nèi)模型的開(kāi)發(fā)提供了對(duì)腫瘤基質(zhì)在導(dǎo)致 mutp53 的 GOF 活性的事件中的作用的深入了解。體內(nèi)和 mutp53 PDX 模型可用于研究新藥的效果，以及臨床試驗(yàn)中使用的療法，這些療法基于 mutp53 蛋白對(duì)野生型活性的重新激活 。
目前，在診斷時(shí)，患者分為野生型和突變型 p53；然而，Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組可以想象一個(gè)基于 mutp53 等位基因活動(dòng)的功能分類(lèi)，該等位基因已在基礎(chǔ)研究中得到表征。這可能會(huì)影響基于 mutp53 的功能活性而不是基因修飾的治療選擇。這種研究具有TP53突變的散發(fā)性腫瘤的方法可以轉(zhuǎn)化為對(duì) Li-Fraumeni 綜合征 表型的研究。
3. Li-Fraumeni 綜合征中TP53的突變景觀
與遺傳疾病相關(guān)的生發(fā)變異的解釋由美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)院 (ACMG) 提供的指南標(biāo)準(zhǔn)化，基于各種標(biāo)準(zhǔn)，這些標(biāo)準(zhǔn)考慮了一系列表征遺傳變異的特征 。賊近，這些標(biāo)準(zhǔn)得到了改進(jìn)，對(duì)它們進(jìn)行了定制，用于對(duì)TP53種系變體進(jìn)行分類(lèi) 。
在 Li-Fraumeni 綜合征 中，種系TP53突變的分布與散發(fā)性腫瘤中發(fā)現(xiàn)的相似，但在世界各地的某些人群中存在一些例外，Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組將在后面描述。其中許多突變位于 DBD 中，其中六個(gè)是散發(fā)性腫瘤常見(jiàn)的熱點(diǎn)：p.Arg175His、p.Gly245Asp、p.Gly245Ser、p.Arg248Gln、p.Arg248Trp、p.Arg273Cys、p.Arg273His 和 p。 Arg282Trp (圖 3A) 。在 Li-Fraumeni 綜合征 和散發(fā)性腫瘤中，這些熱點(diǎn)與患者預(yù)后較差有關(guān)。然而，他們的解釋仍然具有挑戰(zhàn)性。TP53變體可以通過(guò)功能喪失 (LOF) 或 DN 效應(yīng)起作用。無(wú)意義和移碼變體更容易解釋?zhuān)驗(yàn)樗鼈円悦黠@的方式損害蛋白質(zhì)功能，產(chǎn)生過(guò)早的終止密碼子。雖然比錯(cuò)義更罕見(jiàn)，但在相當(dāng)大比例的 Li-Fraumeni 綜合征 患者中發(fā)現(xiàn)了這些變異 。但是，TP53的類(lèi)型和位置Li-Fraumeni 綜合征 中的變異，即使它們與散發(fā)性腫瘤中的相同，也會(huì)影響 mutp53 蛋白的生物學(xué)活性和不同類(lèi)型腫瘤的發(fā)展，其差異取決于家族史。圖 3B）。另一方面，疾病的外顯率和發(fā)生繼發(fā)性腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)受TP53種系突變類(lèi)型的影響。對(duì) 214 個(gè) Li-Fraumeni 綜合征 家族的詳細(xì)分析報(bào)告稱(chēng)，96% 的點(diǎn)突變、67% 的錯(cuò)義突變和 35% 的顯性負(fù)突變，沿 DBD 分布。
( A ) 棒棒糖圖顯示了 Li-Fraumeni 綜合征中的六個(gè)突變 p53 種系變體及其突變頻率。（乙）帕累托圖表示 Li-Fraumeni 綜合征 癌癥中六個(gè)突變 p53 熱點(diǎn)的發(fā)生頻率。根據(jù)帕累托分析，橙色條代表具有更高百分比的TP53突變的腫瘤。
與錯(cuò)義變體相比，截?cái)嘧凅w（移碼和無(wú)義）的外顯率仍然存在爭(zhēng)議且仍不清楚 。賊近發(fā)表了兩項(xiàng)具有廣泛基因型-表型相關(guān)性分析的研究。先進(jìn)個(gè) 將TP53變體分類(lèi)為截?cái)啵◣в羞^(guò)早終止密碼子）、有或沒(méi)有 DN 的錯(cuò)義，正如 Giacomelli 及其同事先前報(bào)道的 ，以及相關(guān)TP53熱點(diǎn)中的錯(cuò)義：p.Arg175His、p.Gly245Asp 、p.Gly245Ser、p.Arg248Gln、p.Arg248Trp、p.Arg249Ser、p.Arg273Cys、p.Arg273His 和 p.Arg282Trp 。這項(xiàng)研究的結(jié)果表明，截?cái)嗪蜔狳c(diǎn)變體對(duì)癌癥嚴(yán)重程度的影響更大。第二項(xiàng)研究描述了TP53變體，也遵循 Giacomelli 等人的標(biāo)準(zhǔn)，但考慮了可能的 DN 或 LOF 機(jī)制。在這兩項(xiàng)研究中，與其他變體相比，錯(cuò)義變體的一個(gè)子類(lèi)對(duì)癌癥的降低作用很小但顯著，mutp53 LOF 的存在可能與增加疾病的嚴(yán)重程度有關(guān)。
不同的TP53種系改變賦予與腫瘤表型優(yōu)先關(guān)聯(lián)的概念得到了證據(jù)的支持，即巴西南部創(chuàng)始突變TP53 p.R337H 的攜帶者主要表現(xiàn)出兒童的腎上腺皮質(zhì)腫瘤 (ACT)，盡管 ACT 是罕見(jiàn)的癌癥 。p53 蛋白的 377 個(gè)氨基酸殘基位于四聚化結(jié)構(gòu)域內(nèi)，有趣的是，這是迄今為止少有與 Li-Fraumeni 綜合征 顯著相關(guān)的突變類(lèi)型 。
然而，賊近有文獻(xiàn)證明 mutp53R337H 的外顯率較低，但 ACT 的侵襲性因腫瘤被診斷的年齡而異 。在 Li-Fraumeni 綜合征 巴西家庭中證明了母體突變等位基因遺傳的優(yōu)勢(shì)。此外，非常重要的是，在某些家庭中，通過(guò)應(yīng)用Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組將在以下章節(jié)中描述的多倫多篩查方案，在無(wú)癥狀攜帶者中診斷出 9 種惡性腫瘤 。重要的是，ACT 中的其他遺傳改變包括 ATRX 中的體細(xì)胞突變，該突變編碼參與重塑和端粒結(jié)構(gòu)維持的解旋酶。在 Pinto 等人的研究中，通過(guò) WGS 和 WES、種系TP53分析了 37 個(gè) ACT37 名患者中有 25 名（68%）存在突變。在 19 個(gè) ACT 中的 6 個(gè)（32%）中鑒定了ATRX體細(xì)胞無(wú)義突變和刪除多個(gè)外顯子的 SV，所有這些都與生殖系TP53突變相關(guān)。在TP53體細(xì)胞純合缺失的情況下，WES 還鑒定了ATRX R2164S 體細(xì)胞錯(cuò)義突變，種系TP53和體細(xì)胞 ATRX 突變都與基因組異常有關(guān) 。
一項(xiàng)有趣的研究將 TP53-R337H 與 XAF1 因子相關(guān)聯(lián)。使用 NGS 和 WES 分析了來(lái)自 203 名癌癥患者和 582 名親屬的 DNA。作者報(bào)告說(shuō)，野生型 XAF1 增強(qiáng)了 wtp53 的反式激活，而 XAF1 E134* 減弱了調(diào)節(jié)活性。總之，單倍型 R337H 和 E134* 可以調(diào)節(jié)癌癥表型 。
除了巴西特有的突變外，在來(lái)自德系猶太人祖先的四個(gè)獨(dú)立家族后裔的九個(gè)人中發(fā)現(xiàn)了一種罕見(jiàn)的 p53 四聚結(jié)構(gòu)域錯(cuò)義突變（c.1000G>C；p.G334R），表明這是一個(gè)創(chuàng)始人突變。這些個(gè)體的特征是多種遲發(fā)性 Li-Fraumeni 綜合征 譜癌，并且可用的腫瘤顯示TP53的雙等位基因體細(xì)胞失活。體外實(shí)驗(yàn)表明 mutp53G334R 不能反式激活 wtp53 的部分靶基因，從而提高細(xì)胞增殖活性和形成菌落的能力 。這些數(shù)據(jù)表明，該種族和 c.1000G>C 攜帶者的后代應(yīng)接受篩查和預(yù)防措施以降低癌癥風(fēng)險(xiǎn)。
有一些重要的基因改變會(huì)影響 Li-Fraumeni 綜合征 表型，例如 MDM2 先進(jìn)個(gè)內(nèi)含子內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性（SNP）（NM_002392.3：c.14+309T>G；SNP309；rs2279744）；TP53多態(tài)性，例如內(nèi)含子 3 (PIN3)、Pro72Arg 內(nèi)的重復(fù)；端粒長(zhǎng)度；miRNA 中的差異甲基化或變異等位基因改變 p53 介導(dǎo)的細(xì)胞調(diào)節(jié)，以及拷貝數(shù)變異 (CNV) 的積累 。更常見(jiàn)的 Pro72Arg 多態(tài)性的影響仍然存在爭(zhēng)議，并且 MDM SNP309 T>G 被證明與 mutp53 攜帶者中加速的腫瘤形成有關(guān)。法國(guó)一項(xiàng)基于 61 名TP53有或無(wú)種系突變的個(gè)體的研究結(jié)果來(lái)自 41 個(gè) Li-Fraumeni 綜合征 家族證實(shí) MDM2 多態(tài)性對(duì)腫瘤的發(fā)病年齡有影響，這種影響可能會(huì)被 Pro72Arg 多態(tài)性放大，并且組間的差異也顯示出這兩種多態(tài)性的累積效應(yīng) 。
賊近，第二個(gè) MDM2 多態(tài)性 SNP285G>C (rs117039649) 被證明與 SNP309G 等位基因相關(guān) 。在一項(xiàng)針對(duì) 195 名 Li-Fraumeni 綜合征 患者的大型研究中，這種單倍型被證明會(huì)影響 5 年前發(fā)生的腫瘤的癌癥發(fā)病 。其他遺傳因素已被報(bào)道為 Li-Fraumeni 綜合征 表型的潛在修飾因子，例如 hsa-miR-605 (rs2043556) 中的 SNP 。
這些修飾物如何持續(xù)影響 Li-Fraumeni 綜合征 表型的知識(shí)程度仍有待評(píng)估。
4. 非編碼 RNA 在 Li-Fraumeni 綜合征 中的作用：新機(jī)制和假設(shè)
迄今為止，MDM2 SNP309 和 p53 Arg72Pro 多態(tài)性以及 DNA 拷貝數(shù)變異 (CNV) 與 Li-Fraumeni 綜合征 中的癌癥風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，進(jìn)一步作為這些患者臨床監(jiān)測(cè)的標(biāo)志物。賊近，有人強(qiáng)調(diào)非編碼 RNA 可用于相同目的。
Wt 和 mut p53 的表達(dá)與 microRNAs (miRNAs)、長(zhǎng)鏈非編碼 RNAs (lncRNAs) 和環(huán)狀 RNAs (circRNAs) 的表達(dá)相關(guān)，其主要功能是細(xì)化與細(xì)胞增殖和新陳代謝 。從 Li-Fraumeni 綜合征 的角度來(lái)看，miR-605 (rs2043556) 中常見(jiàn)的單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 與胃腸道癌癥風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，其賊重要的報(bào)告功能之一是靶向 MDM2 mRNA，這是蛋白質(zhì)的主要調(diào)節(jié)因子之一wt 和 mut p53 的穩(wěn)定性。E3 泛素-蛋白連接酶 MDM2 建立了一個(gè)負(fù)反饋回路來(lái)限制 p53 的功能，然而，高水平的 miR-605 會(huì)抑制 p53/MDM2 相互作用，從而導(dǎo)致 p53 積累 。與此一致，據(jù)報(bào)道，與常見(jiàn)的純合 AA 基因型相比，miR-605 rs2043556（G 等位基因變體）與 Li-Fraumeni 綜合征 腫瘤發(fā)病的較早平均年齡顯著相關(guān) 。
探索 238 名攜帶TP53 p.R337H 的巴西人的 Li-Fraumeni 綜合征 隊(duì)列，57.1% 的患者存在 miR-605 rs2043556 G 等位基因，其中 10.5% 是純合子 。有趣的是，在這組 Li-Fraumeni 綜合征 患者中，miR-605 rs2043556 的存在與多個(gè)原發(fā)性腫瘤的發(fā)病顯著相關(guān) 。
這些發(fā)現(xiàn)應(yīng)進(jìn)一步研究 Li-Fraumeni 綜合征 表型和基因型的不同方面，強(qiáng)烈表明 SNP 介導(dǎo)的 miR-605 失調(diào)可能通過(guò)誘導(dǎo) p53/MDM2 水平的一些變化來(lái)影響 Li-Fraumeni 綜合征 的癌癥風(fēng)險(xiǎn)。此外，他們揭示了一種新的情況，即存在非編碼 RNA 修飾劑，并可能使TP53突變攜帶者易受 Li-Fraumeni 綜合征 的一系列易感性影響。
賊近，有報(bào)道稱(chēng) mutp53/HIF1α/miR-30d 軸在散發(fā)性乳腺癌中誘導(dǎo)了幾種分泌途徑成分的改變，例如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的增加、COP-I 和 COP-II 囊泡數(shù)量的增加。 、微管的穩(wěn)定化和高爾基體的囊泡管?？傊?，這些修飾影響了可溶性因子的分泌以及細(xì)胞外基質(zhì) (ECM) 的沉積和重塑，從而影響了腫瘤微環(huán)境的信號(hào)網(wǎng)絡(luò) 。在同一篇論文中，作者還表明，在來(lái)自兩個(gè) Li-Fraumeni 綜合征 TP53的成年原代成纖維細(xì)胞中與來(lái)自兩個(gè) wtp53 健康供體的成纖維細(xì)胞相比，p.R248Q 患者，mutp53 表達(dá)與更高的 HIF1α 和 miR-30d 水平以及更高的蛋白質(zhì)分泌相關(guān)。這些結(jié)果支持了一個(gè)令人著迷的假設(shè)，即 mutp53/miR-30d 軸導(dǎo)致 ECM 重塑因子的分泌增加，這些因子也在 Li-Fraumeni 綜合征 中通過(guò)改變的分泌組在促進(jìn)癌癥進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用。
在散發(fā)性腫瘤中，非編碼 RNA 領(lǐng)域不斷探索疾病的預(yù)測(cè)性生物標(biāo)志物或治療的功效，不僅在腫瘤組織和轉(zhuǎn)移瘤中，而且在血液、唾液等體液中，和尿液，經(jīng)過(guò)上述研究，這種研究在Li-Fraumeni 綜合征領(lǐng)域從未開(kāi)花結(jié)果。相比之下，近年來(lái)，將 mutp53 與非編碼 RNA 特征聯(lián)系起來(lái)的論文數(shù)量正在增加，這些論文來(lái)自癌癥患者的液體活檢并被賦予了疾病的預(yù)測(cè)能力和/或治療的功效.
直到今天，Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組已經(jīng)了解到癌癥分子途徑中非編碼 RNA 相互作用的失調(diào)會(huì)導(dǎo)致腫瘤形成并顯示出重要的新藥靶點(diǎn)。在散發(fā)性癌癥中，基因突變的發(fā)生通常不僅涉及突變基因，還可能破壞非編碼 RNA 網(wǎng)絡(luò)，從而改變這些 ncRNA 下游靶標(biāo)的平衡。
因此，識(shí)別與 Li-Fraumeni 腫瘤基因型和表型相關(guān)的任何非編碼 RNA 對(duì)于基礎(chǔ)知識(shí)和實(shí)施更好的治療和主動(dòng)監(jiān)測(cè)策略都是非常有利的。
5. 腫瘤防治
據(jù)估計(jì)，全世界約有 1000 個(gè)多代家庭受到 Li-Fraumeni 綜合征 的影響，發(fā)生率沒(méi)有種族或地域差異，盡管在巴西南部和東南部記錄了異常高的 Li-Fraumeni 綜合征 患病率 。已知疾病發(fā)作通常發(fā)生在患有多種癌癥的兒童和年輕人身上，賊顯著的是軟組織和骨肉瘤 。具有新生種系TP53致病性變異的個(gè)體比例估計(jì)在 7% 到 20% 之間 。重要的是，并非所有患有 mutp53 的人都會(huì)患上癌癥，但風(fēng)險(xiǎn)明顯高于普通人群。一旦患者被診斷出患有 Li-Fraumeni 綜合征，重要的是所有家庭成員都進(jìn)行早期癌癥的遺傳咨詢和監(jiān)測(cè) 。
用于決定是否確定個(gè)人（先證者）患有 Li-Fraumeni 綜合征 的標(biāo)準(zhǔn)是什么？有多種已公布的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)測(cè)試個(gè)體的TP53雜合種系致病性變異，包括賊近修訂的 Chompret 標(biāo)準(zhǔn) 。在先證者中，經(jīng)典的 Li-Fraumeni 綜合征 診斷遵循三個(gè)基本標(biāo)準(zhǔn)：在 45 歲之前診斷出肉瘤；一級(jí)親屬（父母、兄弟姐妹或孩子）在 45 歲之前患有任何癌癥；一級(jí)親屬或二級(jí)親屬，即祖父母、阿姨/叔叔、侄女/侄子或?qū)O子，在 45 歲之前患有任何癌癥，或在任何年齡被診斷出患有肉瘤。賊近，強(qiáng)烈建議使用 Chompret 標(biāo)準(zhǔn)來(lái)識(shí)別超出上述經(jīng)典標(biāo)準(zhǔn)的受影響家庭。任何家族史符合以下三個(gè)更新標(biāo)準(zhǔn)之一的人都可以考慮診斷 Li-Fraumeni 綜合征 并檢測(cè)TP53基因突變，這些更新標(biāo)準(zhǔn)可以在 Frebourg 等人的文章中詳細(xì)閱讀。。重要的是，Chompret 評(píng)估的診斷標(biāo)準(zhǔn)提高了TP53的敏感性即使沒(méi)有家族史，也可以通過(guò)包括核心 Li-Fraumeni 綜合征 腫瘤的患者來(lái)檢測(cè)致病性種系變異。經(jīng)典和 Chompret 標(biāo)準(zhǔn)共同將診斷敏感性提高到 95%，因此，國(guó)家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò) (NCCN) 和其他指南建議同時(shí)使用經(jīng)典 Li-Fraumeni 綜合征 標(biāo)準(zhǔn)和修訂后的 Chompret 標(biāo)準(zhǔn)來(lái)推薦TP53種系基因檢測(cè)。
Li-Fraumeni 樣綜合征 (LFL) 是一種與 Li-Fraumeni 綜合征 相關(guān)的病理學(xué)，其中為不符合經(jīng)典標(biāo)準(zhǔn)的受影響家庭制定了一套標(biāo)準(zhǔn) 。LFL 有兩個(gè)建議的定義，稱(chēng)為“Birch”和“Eeles”定義，它們引入了 Li-Fraumeni 譜的概念，包括檢測(cè)具有較低外顯率的變異，這是遺傳性癌癥相關(guān)綜合征TP53 (hTP53rc)的更廣泛分類(lèi)，以及那些具有“表型 Li-Fraumeni 綜合征”的人，這意味著具有癌癥發(fā)病率和家族史但沒(méi)有已知遺傳驅(qū)動(dòng)因素的患者。
不幸的是，目前沒(méi)有針對(duì) Li-Fraumeni 綜合征 的特定治療或標(biāo)準(zhǔn)指南或針對(duì)種系TP53基因變體的特定治療。因此，通常會(huì)不時(shí)評(píng)估腫瘤的類(lèi)型，并采用用于經(jīng)典癌癥患者的療法。幾項(xiàng)研究表明，與因癥狀出現(xiàn)而被診斷為癌癥的 Li-Fraumeni 綜合征 患者相比，通過(guò)跟蹤癥狀前惡性腫瘤，對(duì) Li-Fraumeni 綜合征 患者進(jìn)行主動(dòng)監(jiān)測(cè)與提高生存率顯著相關(guān)?？傮w而言，這些研究提出了使用身體檢查和頻繁的生化和影像學(xué)研究的臨床監(jiān)測(cè)方案，例如包括全身磁共振成像 (MRI)、腦乳腺特異性 MRI、乳房 X 光檢查、腹部和盆腔超聲以及結(jié)腸鏡檢查。所有這些非常重要的發(fā)現(xiàn)都應(yīng)該成為準(zhǔn)備通用 Li-Fraumeni 綜合征 監(jiān)測(cè)和治療登記的材料，從遺傳咨詢到主動(dòng)監(jiān)測(cè)。
一些國(guó)家已經(jīng)建立了 Li-Fraumeni 綜合征 家庭的不同協(xié)會(huì)，以盡可能多地了解這種罕見(jiàn)的遺傳性疾病。Li-Fraumeni 綜合征及腫瘤風(fēng)險(xiǎn)基因檢測(cè)質(zhì)量提升小組可以提到美國(guó)的 Li-Fraumeni 綜合征A（Li-Fraumeni 綜合征協(xié)會(huì)）、英國(guó)的 George Pantziarka TP53 Trust 或世界各地高度專(zhuān)業(yè)于檢測(cè)生殖系TP53突變和積極監(jiān)測(cè)所涉及的家庭，例如多倫多大學(xué)的團(tuán)隊(duì)，該團(tuán)隊(duì)制定了指南，“多倫多協(xié)議”，已證明對(duì)早期檢測(cè)有效 。
因此，多年來(lái)，科學(xué)家們的研究主要集中在兩個(gè)干預(yù)領(lǐng)域，即一方面闡明TP53特定變體、外顯率和其他流行病學(xué)變量之間關(guān)系的潛在機(jī)制、發(fā)病時(shí)間和腫瘤的發(fā)病率，另一方面，預(yù)防性療法的實(shí)驗(yàn)，以避免癌癥發(fā)作的風(fēng)險(xiǎn)。許多降低 Li-Fraumeni 綜合征 癌癥發(fā)病率的治療干預(yù)措施部分基于對(duì)表達(dá)高水平 mutp53 的散發(fā)性癌癥的治療開(kāi)發(fā)，例如高級(jí)別卵巢癌、三陰性乳腺癌、結(jié)直腸癌或鱗狀細(xì)胞癌頭頸癌
一些研究報(bào)告說(shuō)，放射治療的使用與 Li-Fraumeni 綜合征 患者放射誘發(fā)的腫瘤的發(fā)生有關(guān)。此外，許多患者仍然對(duì)放射治療有抵抗力，這是由一些 p53 突變帶來(lái)的功能獲得性活動(dòng)所帶來(lái)的條件。出于這個(gè)原因，當(dāng)不是先進(jìn)必要時(shí)，應(yīng)限制計(jì)算機(jī)斷層掃描和其他涉及電離輻射的診斷技術(shù)。
有趣的是，已經(jīng)在 Li-Fraumeni 綜合征 患者中開(kāi)展了一些臨床試驗(yàn)，不僅旨在從治療的角度獲得結(jié)果，而且旨在探索 Li-Fraumeni 綜合征 患者預(yù)防癌癥的候選藥物（https://clinicaltrials.gov 于 2022 年 6 月 15 日訪問(wèn)）。
迄今為止，在 2022 年 6 月 15 日訪問(wèn)的 ClinicalTrial.gov 上報(bào)告了 17 項(xiàng)研究，其中 9 項(xiàng)處于招募階段，只有一項(xiàng)已完成并提供結(jié)果。這項(xiàng)賊新研究報(bào)告了關(guān)于在 Li-Fraumeni 綜合征 患者 ( NCT03789175 )中使用煙酰胺核苷 (NR)（維生素 B3）作為膳食補(bǔ)充劑來(lái)改善骨骼肌組織的線粒體功能和呼吸功能的令人鼓舞的數(shù)據(jù) 。
在這些臨床試驗(yàn)中，由美國(guó)國(guó)家癌癥研究所 (NCI) 支持的“二甲雙胍在診斷為 Li-Fraumeni 綜合征的患者中的初步研究” ( NCT01981525 ) 提出了對(duì)現(xiàn)有藥物的重新定位 。二甲雙胍 (Met) 是治療 2 型糖尿病賊常用的藥物，它廉價(jià)、安全、有效地改善高血糖和高胰島素血癥。幾項(xiàng)流行病學(xué)研究表明，接受 Met 治療的糖尿病患者患癌癥的風(fēng)險(xiǎn)較低 。因此，有許多臨床試驗(yàn)使用 Met 作為輔助治療多種癌癥。從分子機(jī)制來(lái)看，Met 可以影響大量分子和細(xì)胞信號(hào)，例如影響糖異生、代謝途徑和線粒體細(xì)胞呼吸。
NCT01981525試驗(yàn)從 Met 抑制氧化磷酸化、減少癌細(xì)胞增殖的可用能量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)開(kāi)始，以評(píng)估 Met 在非糖尿病 Li-Fraumeni 綜合征 患者中的安全性和耐受性，并評(píng)估與未服用的 Li-Fraumeni 綜合征 患者相比對(duì)代謝譜的調(diào)節(jié)藥物。這項(xiàng)研究的結(jié)果報(bào)告了這些個(gè)體中預(yù)期的 Met 的出色耐受性和肝線粒體功能的抑制。未來(lái)需要對(duì)兩組患者可能發(fā)生腫瘤的情況進(jìn)行更新。計(jì)劃在加拿大、德國(guó)和英國(guó)進(jìn)行類(lèi)似試驗(yàn)，目的是跟蹤接受和未接受 Met 治療的患者組 5 年，并監(jiān)測(cè)腫瘤的發(fā)作 ( https://www.oncology.ox.ac. uk/clinical-trials/oncology-clinical-trials-office-octo/prospective-trials/mili于 2022 年 6 月 15 日訪問(wèn)）。
有趣的是，腫瘤的基因組分析正在成為轉(zhuǎn)化研究中的常規(guī)做法，并且有助于確定個(gè)性化醫(yī)療的可操作分子靶標(biāo)。
這些發(fā)現(xiàn)啟發(fā)了一種新方法，其中使用比較轉(zhuǎn)錄組分析在 12.747 個(gè)腫瘤 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)集（包括 200 個(gè) GBM）的癌癥綱要中確定了一組在 Li-Fraumeni 綜合征 多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（GBM）患者中正確過(guò)表達(dá)的基因，為識(shí)別個(gè)性化藥物治療。STAT1 和 STAT2 基因被確定在 Li-Fraumeni 綜合征 患者中過(guò)度表達(dá)，而魯索替尼是 JNK 抑制劑，可用作阻斷 JNK/STAT1,2 通路的潛在療法。通過(guò)使用基因組和轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法以及源自患者的類(lèi)器官對(duì)可操作靶點(diǎn)的研究可以代表許多癌癥治療試驗(yàn)的基礎(chǔ)。
6、佳學(xué)基因檢測(cè)對(duì)Li-Fraumeni 綜合征基因檢測(cè)的評(píng)論
Li-Fraumeni 綜合征 和TP53種系突變之間的密切聯(lián)系使這種遺傳性癌癥綜合征成為研究突變 p53 蛋白的獨(dú)特且有用的范例。此外，關(guān)于 mutp53 在散發(fā)性腫瘤中的分子作用機(jī)制已經(jīng)了解很多。然而，無(wú)法預(yù)測(cè)突變攜帶者何時(shí)會(huì)出現(xiàn)腫瘤以及如何治療這些 Li-Fraumeni 綜合征 人。
當(dāng)然，整合臨床實(shí)踐的不同學(xué)科之間的合作研究，以及基因組、代謝組學(xué)和生物學(xué)分析的結(jié)果，將有利于加深對(duì)這種癌癥易感綜合征的理解，以找到編碼途徑。
這些信息可能是解釋 Li-Fraumeni 綜合征 不同表現(xiàn)的重要來(lái)源，例如疾病和外顯率的差異以及出現(xiàn)的腫瘤的異質(zhì)性。夢(mèng)想是確定疾病表型的驅(qū)動(dòng)因素，以微調(diào)個(gè)性化監(jiān)測(cè)方案的發(fā)展。
